21世纪初(🤸)，人类将多数人(💪)留在被哥(🈴)斯(sī )拉蹂躏(🤷)的(de )地球上，仅使被选(💠)中的人(🏯)们乘(🎋)上恒星间(jiān )(🧟)移民(mín )船·阿拉特拉姆，前(❕)往能够(gòu )移(yí )居(jū )的(🍑)“约定(dìng )之地·τ星e”。但这一计(jì )划失败，人类只得再度返回地(🔈)球。而长距离亚空间航(😙)行所引发的时空歪曲，导致人类回到的(de )地(dì )方变成(🔎)了(le )“两(🌱)万年后的地球(💣)”。在这(📞)个(gè )(⏳)地(🏓)球，主人公·晴男等人在遭受哥(🐂)斯拉袭(xí )(⏺)击的(de )同时，与埃克西弗(🎴)、比尔沙(🍹)尔(ěr )德两(liǎng )种族(🈺)的异(🧥)星人(👅)共同实行谋划(🌲)了20年(🐌)的“对(duì )(💛)哥斯拉战术(shù )”，通(🈸)过(guò )(🙅)殊死战(🍾)斗成功击(jī )倒(dǎo )了哥斯拉。　　但(🤯)喜悦(🍑)并未持续多(🎁)久(⤴)，深藏(💼)地下的真(zhēn )正(zhèng )哥斯(sī )(🈹)拉“哥斯拉·地球”现身(🌳)了。两万年间持(🏺)续(xù )成长生(shēng )存、(🐋)身高300米、质(zhì )量(🧚)超(🌵)过(guò )10万吨(dūn )，在进化(huà )成这种姿态(💃)的超巨大哥(gē )斯拉压倒性的破坏力面前，晴男等(děng )人落花流水。　　拯救了晴男(nán )的是被视为(wéi )(🚱)人类(lèi )的(de )残存者“弗图亚(🙃)”之民(mín )，米(mǐ )(🎯)亚娜。弗图亚(📼)是(shì )他们在这(🐕)个地球首次遇(🍵)到的人(rén )型生(shēng )命种族。他们(men )会是人类的子孙吗(👷)——。“弗图亚的神也被哥斯拉击破，如(📫)今只剩下卵(luǎn )。挑战(zhàn )者、抗争者(zhě )(🐥)，全部被火(huǒ )焰(yàn )吞噬(🥇)而消(🀄)失(🚴)了(le )”面对这样的他们，晴(🏆)男回应道(📲)“这(zhè )是以人类的(de )(🔙)双(🌳)手夺回地球的(👲)最后(hòu )机会(huì )(☔)了(le )(🎿)”。　　另一方面，比尔沙(🚪)尔德的指(🆖)挥(huī )官·(🌵)加尔格，注意到弗图(tú )亚使用的箭头是(🌯)由“自(⏭)律(🔆)思考金(🏢)属体·纳(nà )米金属”所制造而(ér )欢(huān )喜。这(zhè )和21世(🥍)纪他们(🏁)在(zài )富(fù )士山麓作为“对(duì )哥斯(sī )拉(lā )决战兵器”所(suǒ )开发(fā )、在(zài )(🍆)启(qǐ )动(🥇)前遭到破坏的(😳)“机(🌔)械哥斯(sī )拉”由同种物质所构成。这正是(shì )当时的(de )开发(🚁)设备至今仍然(rán )残存(cún )的证明——(🤕)。